上海石油化工研究院高性能计算项目-宝德计算

材料模拟（分子动力学方法）计算材料学的内涵可以概括为：根据材料科学和相关科学基本原理，通过模型化与计算实现对材料制备、加工、结构、性能和使役行为等参量或过程的定量描述，理解材料结构与性能、功能之间的关系，引导材料发现和发明，缩短材料研制周期，降低材料过程成本。

计算材料学主要包括两个方面的内容：一方面是计算模拟，即从实验数据出发，通过建立数学模型及数值计算，模拟实际过程；另一方面是材料的计算机设计，即直接通过理论模型和计算，预测或设计材料结构与性能。材料计算与模拟在材料性能设计、节约材料与节能、加快产业化进程中发挥着重要的作用。

分子动力学方法是一种计算机模拟实验方法，是研究凝聚态系统的有力工具。该技术不仅可以得到原子的运动轨迹，还可以观察到原子运动过程中各种微观细节。它是对理论计算和实验的有力补充。广泛应用于材料科学、生物物理和药物设计等。

本方案在宝德对 HPC 深刻理解的基础上结合对用户应用场景的深入分析而设计，可谓特色鲜明：

序号	对象	宝德方案特点
1	计算系统	计算系统由 10 台宝德高密服务器（四子星）与 4 台宝德自研四路胖节点组成，系统整体理论峰值性能达到 30.45TFlops，实测性能 25.36TFlops，效率超过了 80％。
2	网络系统	采用业界最先进的 Infiniband 网络技术，满足应用对网络的高带宽和低延时的需求。
3	存储系统	通过宝德 Pstor2000 分布式存储系统，提高 IO 并发访问性能

及单一存储容量，实现多通道、多分区的并发读写和多分区的一

致印象和统一管理；高性能、高可扩展、高性价比。

集群管理

使用 WEB 界面管理方式，可提供所有组件的最新状态及图形标示的详细信息；实时状态监控、故障预警，动态优化调整资源配给和工作策略；保存并统计分析关键历史数据；直观显现重要信息的变化趋势；多种错误故障报警方式，日志、审计和报表可供查询；允许加密的远程控制，可从任何位置控制操作及监控整

体运行状况。

安全系统

方案的设计充分考虑科研对于安全性的需求，从计算、存储、网

络，到用户的接入访问、权限控制等，都提供了安全策略。

技术服务

提供至少三年硬件免费保修服务，五年免费人工现场技术服务